Se necesitan con urgencia nuevas metodologías de mejora de cultivos, incluida la explotación de la variación genética natural, para alimentar a nuestra población humana en rápido crecimiento en el contexto del cambio climático global. Aquí describimos un método de "Identificación rápida de variantes de nucleótidos por PCR digital" (FIND-IT) para la identificación rápida de variantes genéticas prediseñadas o alelos raros en grandes poblaciones genómicas. Pueden seleccionarse bibliotecas de 500.000 individuos y aislarse las variantes deseadas en dos semanas. FIND-IT es ampliamente aplicable para extraer diversidad valiosa en cualquier población genómica, incluida la reproducción de élite y las colecciones de germoplasma silvestre.
El método proporciona una resolución de un solo nucleótido que se ha validado mediante la identificación y el aislamiento de líneas knockout, cambios de codones no sinónimos y variantes de miARN y sitios de unión de factores de transcripción en el cultivo de cebada de importancia agronómica. A diferencia de los métodos existentes, FIND-IT no requiere transformación, clonación o pasos enzimáticos, y está exento de las regulaciones de OGM.
Por lo tanto, FIND-IT se puede aplicar inmediatamente a los cultivares de élite y se puede adaptar para minimizar o eliminar los requisitos de retrocruzamiento que requieren mucho tiempo.
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Tamaño: 2,17
Publicado: 23 de noviembre de 2021
Fuente: BioRxiv
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