Kit de diagnóstico para resistencia al tizón del arroz



Las líneas de arroz resistentes al tizón son la solución más efectiva para el tizón bacteriano, causado por Xanthomonas oryzae pv. oryzae ( Xoo ). Los mecanismos de resistencia clave involucran a los genes SWEET como factores de susceptibilidad. Los efectores similares a los activadores de la transcripción bacteriana (TAL) se unen a los elementos de unión a los efectores (EBE) en los promotores de genes SWEET e inducen genes SWEET

Las variantes EBE que no pueden ser reconocidas por los efectores TAL anulan la inducción, causando resistencia. Aquí describimos un kit de diagnóstico para permitir el análisis del tizón bacteriano en el campo y la identificación de líneas resistentes adecuadas. Específicamente, incluimos una base de datos de promotores SWEET , cebadores RT-PCR para detectarSWEET inducción, líneas de arroz reportero diseñadas para visualizar la acumulación de proteínas SWEET y líneas de arroz noqueadas para identificar mecanismos de virulencia en aislamientos bacterianos. 

También desarrollamos el arroz Kitaake editado por el genoma CRISPR-Cas9 para evaluar la eficacia de las mutaciones EBE en la resistencia, el software para predecir el conjunto óptimo de genes de resistencia para una región geográfica específica y dos líneas de arroz "mega" resistentes que permitirán a los agricultores plantar líneas que tienen más probabilidades de resistir el tizón del arroz.

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Publicado: 31 de octubre de 2019

Fuente: Nature

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